Nach drei Tagen mit Vista hier meine erste Übersicht welche Programme funktionieren und welche nicht:
Office 2007, Firefox 2, Thunderbird, World of Warcraft, TeamSpeak, Daemontools, Acrobat Reader,
TV-Browser (und somit auch Java5), GNU GPG, Putty, WinSCP, SharpReader, Psi.
VLC funktioniert, Vista schaltet aber während der Videowiedergabe die Transparenz ab (Vista Basic). Wenn eine Aufforderung zur Eingabe eines Passworts kommt (Vista färbt den Bildschirm dann grau ein), wird die Videowiedergabe danach nicht mehr angezeigt

Workaround: einfach das VLC-Fenster in der Größe verändern..
Windows Media Encoder läuft auf Vista leider auch noch nicht komplett. Das Konvertieren funktioniert zwar, aber Screen-Capture funktioniert nicht.
Vista warnt bei Visual Studio 2005:
This version of Visual Studio 2005 is known to have compatibility issues with the version of Windows you are running.
Da Visual Studio doch ein wenig umfangreicher ist, gibt es bei
Microsoft eine genauere Liste, was Probleme bereitet. Wie
Marco früher kommentiert hat, läuft es bei ihm recht gut.. Beim meinem ersten Versuch stürzte die IDE leider schon beim Einstellen der Optionen ab bzw brauchte 100% CPU

Aber
SP1 ist ja schon in Arbeit..
Für Visual Studio.Net 2003 und die Vorgänger ist bei Vista leider Schluß
Virtual PC wird Vista erst ab der Version 2007 unterstützen - eine Testinstallation mit 2004 habe ich nicht gemacht.
Im großen und ganzen würde ich sagen, dass Leute, die einfach einen funktionierenden Rechner haben wollen, erstmal warten sollten - immerhin kommt die Version für Endkunden mit Absicht erst in ein paar Wochen. Das Problem ist nicht das Betriebssystem sondern die vielen Anwendungen, die auf Neuerungen angepasst werden müssen. Das dies aufwändig ist, zeigt nicht zuletzt, dass viele Microsoft-Anwendungen noch nicht einwandfrei funktionieren.
Update 21.11.2006:
Zugriff auf Samba Version 3.0.14 als Gast ist nicht möglich

Im
Changelog für 3.0.20 steht was über Vista-Änderungen, aber ich konnte es noch nicht ausprobieren.
VMWare Workstation ist auch noch nicht wirklich Vista-geeignet - insbesondere das Verhalten beim Starten einer VM macht es fast unbrauchbar..
Update 22.11.2006:
Der Fehler beim Samba-Zugriff lag an der Samba-Konfiguration - ein Windows XP konnte auch nicht als Gast zugreifen
CDBurnerXP Pro funktioniert nicht, da keine Brenner gefunden werden können. Alternative für das reine Brennen von Images:
ISO Recorder